Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmigd1Q9D7L8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmigd1Q9D7L8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmigd1Q9D7L8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms