Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D7E4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D7E4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D7E4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D7E4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D7E4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D7E4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms