Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc94Q9D6J3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc94Q9D6J3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc94Q9D6J3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms