Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atad1Q9D5T0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atad1Q9D5T0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atad1Q9D5T0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms