Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp6v1e2Q9D593 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp6v1e2Q9D593 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp6v1e2Q9D593 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp6v1e2Q9D593 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms