Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3a3Q9D554 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3a3Q9D554 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf3a3Q9D554 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf3a3Q9D554 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms