Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Zcchc13Q9D548 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zcchc13Q9D548 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Zcchc13Q9D548 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Zcchc13Q9D548 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Zcchc13Q9D548 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Zcchc13Q9D548 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Zcchc13Q9D548 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Zcchc13Q9D548 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Zcchc13Q9D548 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Zcchc13Q9D548 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zcchc13Q9D548 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Zcchc13Q9D548 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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