Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tubgcp4Q9D4F8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tubgcp4Q9D4F8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tubgcp4Q9D4F8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms