Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc6Q9D4E6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpc6Q9D4E6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc6Q9D4E6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pabpc6Q9D4E6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms