Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Pus10Q9D3U0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pus10Q9D3U0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pus10Q9D3U0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pus10Q9D3U0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms