Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chordc1Q9D1P4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chordc1Q9D1P4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chordc1Q9D1P4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms