Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D1F3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D1F3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9D1F3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9D1F3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D1F3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9D1F3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9D1F3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9D1F3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D1F3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D1F3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D1F3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D1F3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D1F3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D1F3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms