Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prpsap1Q9D0M1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prpsap1Q9D0M1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms