Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gtf2e1Q9D0D5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Gtf2e1Q9D0D5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gtf2e1Q9D0D5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Gtf2e1Q9D0D5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gtf2e1Q9D0D5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms