Protein–RNA interactions for Protein: Q9D099

Acer3, Alkaline ceramidase 3, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acer3Q9D099 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Acer3Q9D099 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Acer3Q9D099 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Acer3Q9D099 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Acer3Q9D099 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Acer3Q9D099 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Acer3Q9D099 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Acer3Q9D099 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Acer3Q9D099 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Acer3Q9D099 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Acer3Q9D099 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Acer3Q9D099 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Acer3Q9D099 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Acer3Q9D099 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Acer3Q9D099 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Acer3Q9D099 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Acer3Q9D099 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Acer3Q9D099 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Acer3Q9D099 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Acer3Q9D099 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Acer3Q9D099 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Acer3Q9D099 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Acer3Q9D099 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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Acer3Q9D099 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Acer3Q9D099 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Acer3Q9D099 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Acer3Q9D099 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Acer3Q9D099 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Acer3Q9D099 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Acer3Q9D099 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Acer3Q9D099 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Acer3Q9D099 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Acer3Q9D099 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Acer3Q9D099 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Acer3Q9D099 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Acer3Q9D099 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Acer3Q9D099 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Acer3Q9D099 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Acer3Q9D099 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Acer3Q9D099 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Acer3Q9D099 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Acer3Q9D099 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Acer3Q9D099 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Acer3Q9D099 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Acer3Q9D099 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Acer3Q9D099 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Acer3Q9D099 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms