Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU3

Mtrex, Exosome RNA helicase MTR4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrexQ9CZU3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MtrexQ9CZU3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MtrexQ9CZU3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MtrexQ9CZU3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MtrexQ9CZU3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MtrexQ9CZU3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MtrexQ9CZU3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MtrexQ9CZU3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MtrexQ9CZU3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MtrexQ9CZU3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MtrexQ9CZU3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MtrexQ9CZU3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MtrexQ9CZU3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MtrexQ9CZU3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MtrexQ9CZU3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MtrexQ9CZU3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MtrexQ9CZU3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MtrexQ9CZU3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MtrexQ9CZU3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MtrexQ9CZU3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms