Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYD3

Crtap, Cartilage-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrtapQ9CYD3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CrtapQ9CYD3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CrtapQ9CYD3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CrtapQ9CYD3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms