Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm5Q9CXE0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm5Q9CXE0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm5Q9CXE0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm5Q9CXE0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm5Q9CXE0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm5Q9CXE0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prdm5Q9CXE0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm5Q9CXE0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm5Q9CXE0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm5Q9CXE0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm5Q9CXE0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm5Q9CXE0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm5Q9CXE0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm5Q9CXE0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prdm5Q9CXE0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm5Q9CXE0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm5Q9CXE0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm5Q9CXE0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prdm5Q9CXE0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm5Q9CXE0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm5Q9CXE0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms