Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mgme1Q9CXC3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mgme1Q9CXC3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mgme1Q9CXC3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mgme1Q9CXC3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mgme1Q9CXC3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mgme1Q9CXC3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mgme1Q9CXC3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mgme1Q9CXC3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mgme1Q9CXC3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mgme1Q9CXC3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mgme1Q9CXC3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mgme1Q9CXC3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mgme1Q9CXC3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mgme1Q9CXC3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mgme1Q9CXC3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms