Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prkrip1Q9CWV6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prkrip1Q9CWV6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prkrip1Q9CWV6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Prkrip1Q9CWV6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms