Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sft2d3Q9CSV6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sft2d3Q9CSV6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d3Q9CSV6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms