Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dis3Q9CSH3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dis3Q9CSH3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Dis3Q9CSH3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms