Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR41

Hypk, Huntingtin-interacting protein K, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HypkQ9CR41 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HypkQ9CR41 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HypkQ9CR41 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HypkQ9CR41 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HypkQ9CR41 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HypkQ9CR41 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HypkQ9CR41 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HypkQ9CR41 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms