Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9CQC3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9CQC3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9CQC3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9CQC3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9CQC3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CQC3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9CQC3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9CQC3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CQC3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CQC3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CQC3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CQC3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9CQC3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9CQC3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9CQC3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9CQC3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CQC3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CQC3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CQC3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CQC3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CQC3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CQC3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CQC3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CQC3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CQC3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CQC3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9CQC3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CQC3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CQC3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9CQC3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms