Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA3

Sdhb, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhbQ9CQA3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SdhbQ9CQA3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SdhbQ9CQA3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SdhbQ9CQA3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SdhbQ9CQA3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SdhbQ9CQA3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SdhbQ9CQA3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SdhbQ9CQA3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SdhbQ9CQA3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SdhbQ9CQA3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SdhbQ9CQA3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms