Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700029P11RikQ9CQ68 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1700029P11RikQ9CQ68 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms