Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ino80bQ99PT3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ino80bQ99PT3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ino80bQ99PT3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms