Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim12aQ99PQ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim12aQ99PQ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim12aQ99PQ1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim12aQ99PQ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms