Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim3Q99PE5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim3Q99PE5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms