Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rtn4Q99P72 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rtn4Q99P72 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtn4Q99P72 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rtn4Q99P72 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms