Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc12a9Q99MR3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc12a9Q99MR3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc12a9Q99MR3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc12a9Q99MR3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc12a9Q99MR3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc12a9Q99MR3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc12a9Q99MR3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc12a9Q99MR3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc12a9Q99MR3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc12a9Q99MR3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc12a9Q99MR3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc12a9Q99MR3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc12a9Q99MR3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc12a9Q99MR3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc12a9Q99MR3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc12a9Q99MR3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms