Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SncaipQ99ME3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SncaipQ99ME3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SncaipQ99ME3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SncaipQ99ME3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.7 ms