Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99M08 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99M08 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99M08 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99M08 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99M08 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99M08 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99M08 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q99M08 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99M08 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99M08 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99M08 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99M08 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99M08 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99M08 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99M08 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99M08 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99M08 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99M08 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99M08 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99M08 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q99M08 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99M08 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99M08 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99M08 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99M08 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99M08 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99M08 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99M08 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99M08 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q99M08 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99M08 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99M08 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99M08 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99M08 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q99M08 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99M08 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99M08 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99M08 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99M08 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99M08 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99M08 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99M08 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99M08 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99M08 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99M08 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99M08 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99M08 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99M08 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99M08 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99M08 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q99M08 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q99M08 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q99M08 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99M08 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99M08 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99M08 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99M08 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99M08 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99M08 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99M08 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99M08 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q99M08 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99M08 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99M08 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99M08 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99M08 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99M08 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99M08 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99M08 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q99M08 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99M08 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99M08 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99M08 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99M08 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99M08 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99M08 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99M08 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99M08 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q99M08 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99M08 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99M08 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99M08 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99M08 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99M08 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99M08 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99M08 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99M08 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q99M08 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99M08 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99M08 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99M08 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99M08 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99M08 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99M08 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99M08 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99M08 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q99M08 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99M08 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q99M08 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms