Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clp1Q99LI9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Clp1Q99LI9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clp1Q99LI9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms