Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sh3bp5lQ99LH9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sh3bp5lQ99LH9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh3bp5lQ99LH9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms