Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RtcbQ99LF4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RtcbQ99LF4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RtcbQ99LF4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RtcbQ99LF4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms