Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gps1Q99LD4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gps1Q99LD4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gps1Q99LD4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms