Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TriobpQ99KW3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TriobpQ99KW3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TriobpQ99KW3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms