Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN1

Arrdc1, Arrestin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc1Q99KN1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arrdc1Q99KN1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arrdc1Q99KN1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arrdc1Q99KN1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arrdc1Q99KN1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arrdc1Q99KN1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arrdc1Q99KN1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arrdc1Q99KN1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms