Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf19Q99KJ5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf19Q99KJ5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcf19Q99KJ5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms