Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nlgn1Q99K10 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nlgn1Q99K10 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Nlgn1Q99K10 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms