Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcoln1Q99J21 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcoln1Q99J21 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcoln1Q99J21 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcoln1Q99J21 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms