Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Clip1Q922J3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Clip1Q922J3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Clip1Q922J3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Clip1Q922J3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Clip1Q922J3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Clip1Q922J3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Clip1Q922J3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Clip1Q922J3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Clip1Q922J3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Clip1Q922J3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Clip1Q922J3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Clip1Q922J3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Clip1Q922J3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Clip1Q922J3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Clip1Q922J3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Clip1Q922J3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Clip1Q922J3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Clip1Q922J3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Clip1Q922J3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Clip1Q922J3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Clip1Q922J3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Clip1Q922J3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Clip1Q922J3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Clip1Q922J3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Clip1Q922J3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Clip1Q922J3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Clip1Q922J3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Clip1Q922J3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Clip1Q922J3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Clip1Q922J3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Clip1Q922J3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Clip1Q922J3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Clip1Q922J3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Clip1Q922J3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Clip1Q922J3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Clip1Q922J3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Clip1Q922J3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Clip1Q922J3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Clip1Q922J3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Clip1Q922J3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Clip1Q922J3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Clip1Q922J3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms