Protein–RNA interactions for Protein: Q922D8

Mthfd1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd1Q922D8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mthfd1Q922D8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mthfd1Q922D8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mthfd1Q922D8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mthfd1Q922D8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mthfd1Q922D8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mthfd1Q922D8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mthfd1Q922D8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mthfd1Q922D8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mthfd1Q922D8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mthfd1Q922D8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mthfd1Q922D8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mthfd1Q922D8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mthfd1Q922D8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms