Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZT5

Fgd4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd4Q91ZT5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgd4Q91ZT5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fgd4Q91ZT5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgd4Q91ZT5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms