Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Synpo2Q91YE8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Synpo2Q91YE8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Synpo2Q91YE8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Synpo2Q91YE8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Synpo2Q91YE8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Synpo2Q91YE8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.7 ms