Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHI7

Ccdc65, Coiled-coil domain-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc65Q8VHI7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc65Q8VHI7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc65Q8VHI7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc65Q8VHI7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms