Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp4Q8VHC5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cabp4Q8VHC5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cabp4Q8VHC5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.8 ms