Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smg8Q8VE18 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smg8Q8VE18 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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