Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top1mtQ8R4U6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top1mtQ8R4U6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Top1mtQ8R4U6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Top1mtQ8R4U6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Top1mtQ8R4U6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Top1mtQ8R4U6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Top1mtQ8R4U6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top1mtQ8R4U6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top1mtQ8R4U6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top1mtQ8R4U6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top1mtQ8R4U6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top1mtQ8R4U6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top1mtQ8R4U6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top1mtQ8R4U6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top1mtQ8R4U6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top1mtQ8R4U6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
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